如果肛门有疙瘩疼，可能是由于痔疮、直肠脱垂、肛周脓肿和尖锐湿疣等疾病导致的。
1、痔疮。如果外痔形成血栓，即血栓性外痔，患者就可能会出现肛门肿块、疼痛，以及大便带血等症状。当内痔发生脱垂时，也会出现类似症状。
2、直肠脱垂。直肠脱垂是指肛管、直肠以及部分乙状结肠向下方移位，并脱出肛门以外。这种症状肉眼看起来类似肛门出现肿物，且在直肠脱垂的过程中，患者会出现明显疼痛。
3、肛周脓肿。患者主要表现为肛周局部隆起，出现肿块或者硬块，继而出现疼痛、坠胀以及大便秘结等症状。
4、尖锐湿疣。尖锐湿疣是由于HPV感染引起的，发病初期，患者的生殖器或者肛周会出现疣体，即单个或者多个淡红色小颗粒。如果在排便时触破疣体，就可能会引发疼痛、瘙痒。