卵巢巧克力囊肿是否严重，需要分情况而定。
一、当卵巢巧克力囊肿较小时，病情一般不严重，其症状比如痛经、慢性盆腔痛、性交痛、月经异常等通常较轻，囊肿较小一般对怀孕也不会造成明显影响，通常无需手术，可先行保守治疗，主要是药物治疗，包括非甾体类抗炎药及激素类药物。
二、当卵巢巧克力囊肿体积较大，超过4厘米以上时，就算比较严重，因为该类患者的症状往往比较明显，并发症风险也较高，癌变风险较大。
- 1、症状明显：囊肿越大，引起的症状表现比如痛经、盆腔痛、经量增多等越明显。
- 2、并发症风险高：巧克力囊肿比较大，容易出现盆腔粘连，引起继发性不孕；在剧烈运动或者同房时，可能引起囊肿的破裂或扭转。
- 3、癌变风险大：巧克力囊肿呈周期性增长，有发生恶变的可能。
因此，患有巧克力囊肿者，建议遵医嘱及时进行规范治疗。