卵巢囊肿并不存在最好的治疗方法，常用治疗方法包括保守治疗和手术治疗，需根据囊肿的具体性质和临床症状选择最合适的方法。
一、保守治疗。
- 1、观察随诊：临床上发现较小且无明显症状的卵巢囊肿，一般认为是生理性囊肿的可能性大，可先不进行治疗干预，定期复查超声，观察囊肿发展情况即可。生理性囊肿会在3~6月后随月经结束而自行缩小、消失，不会对机体健康造成损害。
- 2、药物治疗：对于不能自行消失，又尚无手术指征的囊肿，可采用药物保守治疗，具体用药需根据囊肿性质决定。如果是卵巢子宫内膜样囊肿，可以口服短效避孕药来刺激内膜组织萎缩，从而消除囊肿。如果是感染导致的卵巢囊肿，需要口服或静脉注射抗生素来缓解炎症，从而治疗囊肿。
二、手术治疗。
- 对于囊肿长期存在、持续增大，或出现囊肿破裂、蒂扭转等紧急情况的患者，需要及时进行手术治疗。对于育龄期且有生育需求的患者，可选择卵巢囊肿剥除手术；对于绝经后出现囊肿、恶变可能性高的患者，可直接切除患侧卵巢及输卵管。
需要注意的是，在治疗完成后，卵巢囊肿仍有一定的复发可能，因此，患者需要定期进行妇科B超复查。