卵巢囊肿可能会发生癌变，但癌变的几率一般较低。
卵巢囊肿是卵巢内或其表面形成的囊状结构，一般可分为生理性卵巢囊肿（又称功能性卵巢囊肿）和病理性卵巢囊肿（又称非功能性卵巢囊肿）。其中，生理性卵巢囊肿一般不会发生癌变；而病理性卵巢囊肿具有癌变的可能，但其癌变的风险很低，一般小于1%。
提醒患者的是，卵巢囊肿主要通过B超检查发现，但B超并不能直接判断囊肿的性质，而是需要通过病理检查确定囊肿的性质。因此，如果发现卵巢囊肿，一定要及时到医院妇科进行病理检查，以明确卵巢囊肿的性质，然后再进行针对性治疗。
如果卵巢囊肿发生癌变，早期一般无明显症状，常常是到晚期出现相应临床症状时才被发现。所以，病理性卵巢囊肿一般不建议定期观察，而是及时进行手术治疗。