扁平湿疣和尖锐湿疣的区别，主要体现在二者的发病原因不同、疾病性质不同以及治疗方法不同。
1、发病原因不同：扁平湿疣是由于梅毒螺旋体感染所引起的；而尖锐湿疣是由于人乳头瘤病毒（HPV）感染所引起的。
2、疾病性质不同：扁平湿疣是二期梅毒患者出现的一种特征性皮肤表现；而尖锐湿疣是一种独立的疾病。
3、治疗方法不同：扁平湿疣患者以药物驱梅治疗为主，常用药物包括青霉素类、盐酸四环素、红霉素或多西环素等；而尖锐湿疣患者以抗病毒药物治疗为主，常用药物包括咪喹莫特、鬼臼毒素、干扰素等，针对疣体还可以采用物理治疗及手术治疗。
提醒患者的是，扁平湿疣和尖锐湿疣的表现相似，都可能表现为灰白色的皮肤黏膜增殖性皮损，极其容易混淆。因此，建议患者到正规医院皮肤性病科就诊，在医生指导下进行相关检查，由专业医生明确诊断，并进行针对性治疗。