扁平疣有可能会自愈。
扁平疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染皮肤黏膜所引起的良性赘生物。随着自身免疫力的提高，HPV可能会被抑制，扁平疣也会自行消退，进而达到自愈的效果。临床上，大多数患者的扁平疣可在2~3年或更长时间后自行消退，并且消退后不留痕迹。
提醒患者的是，如果扁平疣出现在面部等暴露部位，影响外貌美观，则建议患者及时到医院皮肤科就诊，在医生指导下使用水杨酸制剂、维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏、重组人干扰素α2b乳膏等药物进行治疗，也可采用CO2激光、液氮冷冻、微波治疗等物理疗法进行治疗，必要时还可通过手术去除疣体。同时，在日常生活中，患者还应该注意避免搔抓、摩擦疣体，以免因自身接种而使其播散，从而加重病情。