精子畸形症可以改善，但不能达到完全没有畸形精子的程度。
精子的形态受多种因素影响，如高温、吸烟、酗酒等非疾病因素，以及肥胖、泌尿系感染、精索静脉曲张、睾丸癌等疾病因素，都会使畸形精子增多，导致精子畸形症的发生。如果能明确具体病因，通过日常生活管理和药物、手术等专业治疗，能够去除病因，逐渐增加正常精子占比，改善精子畸形症。
但是，即便接受了有效治疗，也难以完全消除畸形精子，这是由现行的精子形态判断标准导致的。目前使用的是世界卫生组织第5版标准，是先找出一个标准的精子，用其他精子与它进行对照，如果与之形态不同，即为畸形精子，正常形态的标准定为4%。在此标准下，即使是健康男性的精液中，也很难没有畸形精子。
需要注意的是，精子形态主要影响的是精子与卵细胞结合的能力，不会导致胎儿畸形，而且在现行标准下，大部分畸形精子的功能其实是正常的。所以，男性不必因为畸形精子率高而过度焦虑，只要不超过96%就是正常的。即使确诊了精子畸形症，也可以经过积极治疗改善，或采取辅助生殖手段，都能满足生育需求。