阴茎珍珠样丘疹，一般来说不需要进行治疗；患者强烈要求时，可以进行激光、冷冻等物理治疗。
阴茎珍珠样丘疹是一种发生在阴茎冠状沟水平的良性组织增生性皮肤病，主要表现为珍珠状丘疹，没有疼痛、瘙痒等自觉症状，也不会给患者带来危害；此外，本病也不属于性传播疾病，不会传染给配偶，因此一般不需要进行特殊治疗。
如果患者珍珠样丘疹增生特别明显、心理压力较大，强烈要求进行治疗时，也可采用激光或者冷冻的方法治疗，但对绝大多数患者不推荐这种治疗。
需要注意的是，阴茎珍珠样丘疹容易与尖锐湿疣相混淆，而尖锐湿疣也可引起丘疹样病变，其属于性传播疾病，需要积极进行治疗。尖锐湿疣主要引起疣状或菜花状的丘疹，而不是排列规则的珍珠状丘疹，这种差异有助于鉴别。如果患者自身难以进行判断，则应及时前往正规医院男科就诊，通过体格检查、醋酸白试验、病理检查等明确病情，然后进行相应处理。