精子活力低的原因尚不完全清楚，目前已经知道的可能与先天因素、感染因素、内分泌因素、免疫因素、微量元素缺乏、环境因素、生活方式等因素有关。
1、先天因素。例如睾丸发育不全，可影响精子的活力。
2、感染因素。男性生殖器官，比如附睾、输精管、前列腺、精囊腺、射精管等部位的感染，都可能影响精子的成活率和活动力。
3、内分泌因素。雄激素水平与精子活力有明显相关性。例如睾酮，其除了能够对精子的发生和成熟有作用以外，对精子的运动能力也会有影响。
4、免疫因素。如果机体受各种因素影响，产生了抗精子抗体，抗精子抗体就会攻击精子，进而阻碍精子的运动，造成其活动力下降。
5、微量元素缺乏。例如缺锌、硒等微量元素，可能会降低精子的活力。
6、环境因素。包括高温、放射暴露和化学毒物的暴露等，也会导致精子活力的降低。
7、生活方式。例如吸烟、酗酒、熬夜、久坐等，都可能导致精子活力低。
除了上述因素外，部分患者并不能查出明确的相关因素，这种不明原因引起的精子活力降低，称为特发性弱精子症。
对于精子活力低的患者而言，如果能查到相关原因，则需要针对病因进行治疗；如果是特发性弱精子症，则治疗会相对困难，临床上多进行经验治疗。