附睾囊肿是否会影响生育不能一概而论，主要取决于病情的严重程度。
1、不影响生育的情况：绝大部分患者的附睾囊肿比较小，病情较轻，由于附睾囊肿本质上是一种囊状组织，虽然在附睾上，但并不在附睾管内，一般来说不会影响精子在附睾内的储存、成熟及输送，所以不影响生育。
2、影响生育的情况：如果患者的附睾囊肿比较大，病情比较严重，比如B超提示附睾囊肿直径较大，患者出现了明显的阴囊坠胀不适、睾丸疼痛，此时可能是附睾囊肿对睾丸造成了压迫，导致局部血液循环障碍所引起的。在这种情况下，由于附睾囊肿可能会影响睾丸的生精功能，造成少精或弱精，从而影响生育。
因此，如果存在附睾囊肿，建议到正规医院的男科或泌尿外科就诊，医生会根据患者的具体情况给出合适的治疗建议。