附睾头囊肿大多不会影响生育。这主要是因为，附睾的头部是由很多条睾丸输出小管进入附睾盘曲形成的，囊肿往往单发，而且绝大多数患者的囊肿比较小，病情较轻，一般不会影响精子在附睾内的储存、成熟及输送，所以不会影响生育。
不过，少数情况下，患者的附睾囊肿比较大，病情比较严重，比如患者出现了明显的阴囊坠胀、阴囊疼痛，并可触及阴囊内肿物，在这种情况下，由于附睾囊肿可能会导致局部血液循环障碍，进而影响睾丸内的血液循环，或者对睾丸造成压迫，从而影响其生精功能，则会影响生育。
总之，附睾头囊肿是良性疾病，发展很慢，一般不会对生育造成重大影响。如果囊肿很大或者有明显不适症状，患者可以到正规医院的泌尿外科或男科就诊，医生会根据囊肿的大小、患者的症状等情况，给予合适的治疗方法。