慢性附睾炎一般是急性附睾炎治疗不彻底引起的，或是慢性前列腺炎及精囊炎引起的并发症。
1、急性附睾炎治疗不彻底：患有急性附睾炎时，如果未进行规范的治疗，病情迁延，会引起慢性附睾炎。
2、慢性前列腺炎及精囊炎引起：患有慢性前列腺炎及精囊炎时，致病菌可以通过输精管管腔逆向进入附睾，或通过淋巴系统到达附睾，引起慢性附睾炎。
3、其他：支原体、衣原体等病原微生物直接感染时，也可能引起慢性附睾炎。此外，膀胱及前列腺术后留置导尿管等，可致长期尿路感染，不断地通过输精管逆行感染或从淋巴系统到达附睾，引起慢性附睾炎。
需要提醒的是，慢性附睾炎容易迁延不愈，不仅影响患者的生活质量，而且双侧附睾感染可因附睾梗阻导致无精子症，造成男性不育，所以患者应积极配合医生进行治疗。