显微取精的适应证主要是非梗阻性无精子症，即由于各种原因导致睾丸生精功能障碍，造成精液中无精子存在的一类疾病。
青春期后腮腺炎并发睾丸炎、隐睾术后、AZFc区缺失、克氏综合征以及特发性无精子症等，都会引起睾丸生精功能障碍，导致精液中没有精子。而常规睾丸穿刺或者睾丸活检比较难找到精子，可以通过显微取精寻找精子。在显微镜下，能更容易区分出有精子的曲细精管和无精子的曲细精管，有效提高取精的成功率。
除了上述非梗阻性无精子症的情况，其实，如果是梗阻性无精子症，比如附睾畸形、附睾梗阻、输精管缺如等，但通过经皮附睾穿刺取精术、睾丸切开取精术等方法失败，也可考虑采取显微取精的方式，来达到生育亲生后代的目的。
需要提醒的是，在显微取精之前，患者最好与医生充分沟通，了解手术过程以及风险，并在术后遵医嘱进行护理。
