精子在睾丸中产生，并在附睾里储存和成熟，所以当睾丸、附睾受到影响时，就可能发生畸形精子症。中医认为畸形精子症主要是由于肾虚、血瘀、湿热、毒邪等因素所引起的。
1、肾虚。中医认为“肾藏精”，即指肾中藏有生殖之精（先天之精）和脏腑之精（后天之精）。当肾精亏虚时，肾脏的生精功能和生精环境会受到一定的影响，从而引起畸形精子症。
2、血瘀。中医认为气血具有为脏腑提供营养物质的作用，当睾丸或附睾出现血行瘀滞的情况时，气血不能到达生精组织，就会导致生精组织的营养支持受到影响，从而引起畸形精子症。
3、湿热。中医认为附睾炎、精索静脉曲张、久坐等，会导致附睾处于一个湿热的环境，其会影响精子的成熟，从而引起畸形精子症。
4、毒邪。接触化学物质、放射线、毒性物质等，可能对精子的成熟造成损害，从而导致畸形精子数量增多。