男性更年期综合征的病因尚未完全明确，目前认为其发病主要与年龄老化、药物滥用、慢性疾病、过度肥胖、不良生活方式及精神心理因素等有关。
1、年龄老化：随着年龄的增长，男性体内内分泌水平会逐渐下降，导致体内雄激素水平降低，而雌激素水平升高，是引起男性更年期综合征的直接原因。
2、药物滥用：很多药物会影响睾丸的内分泌功能和血清睾酮水平，一般认为使用药物剂量越大、疗程越长，对睾丸的内分泌功能损害越大。
3、慢性疾病：很多慢性疾病，特别是下丘脑-垂体轴系统疾病，可加速机体衰老，诱发并加剧男性更年期综合征的进展。
4、过度肥胖：肥胖时，脂肪细胞内的芳香化酶活性明显增强，可以将雄激素转变为雌激素的作用增加，从而导致体内雄激素缺乏，是引起男性更年期综合征的危险因素之一。
5、不良生活方式：包括吸烟、酗酒、营养不良、应激以及接触有毒有害物质等，都有可能影响性功能，从而引起男性更年期综合征。
6、精神心理因素：中老年人如果长期处于焦虑、抑郁等不良情绪，其男性更年期综合征发病率会明显高于一般人群。
需要指出的是，男性更年期综合征可对中老年男性多器官功能造成不良影响，严重降低生活质量，因此，应引起高度重视，本病患者应积极前往正规医院男科、内分泌科、中医科接受诊治。