引起睾丸扭转发生具体原因目前尚不明确，可能和睾丸发育异常、隐睾、睾丸系膜过长、提睾肌异常、外伤、手术、睡眠时迷走神经兴奋或压迫睾丸、遗传因素等有关。
1、由于睾丸发育异常，睾丸、附睾和远段精索完全被脏层鞘膜所包绕，睾丸、附睾悬挂在精索上，在壁层鞘膜囊内可自由活动及旋转，就可能会引发睾丸扭转。
2、隐睾、睾丸系膜过长、睾丸与阴囊附着处发育不全等，都可能会导致睾丸扭转。
3、提睾肌呈螺旋形包绕于精索上，在剧烈收缩时可发生扭转，从而导致睾丸扭转。
4、外伤、异常活动或阴囊内容物手术时，也可能会引起睾丸扭转。
5、睡眠时迷走神经兴奋，提睾肌会随阴茎勃起而痉挛，就可能会导致睾丸扭转。此外，睡眠时，大腿会经常挤压睾丸，使其位置发生改变，也可能导致睾丸扭转。
6、睾丸扭转有一定的遗传倾向。如果家族里有男性发生过睾丸扭转，本人发生睾丸扭转的风险就会有所增高。