灰指甲的鉴别诊断有银屑病、扁平苔藓、手部湿疹等疾病。

1、银屑病和扁平苔藓等全身性疾病，也会出现甲板的破坏，如甲板剥离、颜色改变、萎缩、肥厚等，尤其是没有其他部位皮肤表现的时候，更应该与灰指甲相鉴别，主要通过组织病理学检查及真菌学检查鉴别。

2、手部湿疹也可以导致甲板变形，如有纵脊、横沟等，需要与灰指甲相鉴别，可以通过真菌学检查鉴别。