复方血栓通胶囊可用于治疗视网膜静脉阻塞证属血瘀兼气阴两虚者，也可用于稳定性劳累型心绞痛证属血瘀兼气阴两虚者。以下为本品的合用禁忌：
一、影响药物有效性：本品中丹参易与胃舒平、奥美拉唑、胃得乐、维生素B1、维生素B6形成络合物或沉淀，影响药效，应避免合用。
二、影响用药安全性：
1、本品含有玄参、丹参，根据中药“十八反”的合用禁忌，本品不宜与藜芦及含有藜芦的中成药合用，如三七血伤宁胶囊、神州跌打丸等，以免发生毒副作用。
2、本品含有三七，不宜与异丙肾上腺素合用。三七含肾上腺皮质激素样物质，可使心肌对异丙肾上腺素的敏感性增加，两者联用会增加异丙肾上腺素对心脏的毒性。
3、丹参与抗凝药（如阿司匹林、华法林）药理作用相似，合用可能引发出血。
本品和其他药物合用，也可能发生药物相互作用。因此，为确保安全用药，患者用药期间如需合用任何其他药物，请务必先咨询医生，绝不可擅自合用。