药艾条和纯艾条都可以用于艾灸，但药艾条属于处方药，纯艾条属于二类医疗器械，因此无法比较具体的治疗效果。下面简单介绍一下两种艾条：
药艾条为艾叶（制绒）加桂枝、高良姜、广霍香、降香、香附、白芷、陈皮、丹参、生川乌制成的艾条，具有行气血、逐寒湿的功效，一般用于治疗风寒湿痹、肌肉酸麻、关节四肢疼痛、脘腹冷痛。在医生的指导下也可用于治疗小儿慢性腹泻、小儿脱肛、各种痛症、慢性非细菌性前列腺炎、类风湿关节炎、五更泄、蛇串疮（带状疱疹），及顽固性呃逆、原发性夜间遗尿症、褥疮、溃疡性结肠炎、糖尿病胃轻瘫、骨关节炎等疾病。
纯艾条是使用纯艾绒、艾草制成的艾条，具有祛风散寒、温经止痛等作用，临床上主要用于艾灸。
