清热解毒颗粒可用于治疗风热型感冒，在医生的指导下也用于治疗流行性腮腺炎及轻、中型乙型脑炎。以下为本品的合用禁忌：
一、影响药物有效性：
1、本品含有金银花、连翘，有一定的抗菌作用，不宜与菌类制剂如乳酶生、促菌生等合用，以免影响后者的药效。
2、本品含石膏，石膏中有较多金属离子，与四环素族、异烟肼、红霉素、罗红霉素等大环内酯类抗菌药、奎尼丁、喹诺酮类、左旋多巴等西药同时服用，容易出现络合物影响后者吸收。
3、本品药性寒凉，不宜与滋补性中药同时服用，如人参、黄芪、鹿茸、枸杞等，同时应用会降低药效。
二、影响用药安全性：
1、本品含有玄参，不宜与藜芦及含有藜芦的制品合用，如三七血伤宁胶囊、神州跌打丸等。
2、本品中的石膏富含钙离子，而钙离子能增加强心苷的毒副作用，所以不建议该药与强心苷类药物合用。
本品与其他药物合用也可能会发生药物相互作用，因此服药期间请患者不要自行合用其他药物，如必须合用，请先咨询医生。