头皮毛囊炎患者应用具有抑菌作用的洗发水比较好。
头皮毛囊炎多数是由于细菌、真菌等病原体感染引起的，因此，患者可在医生指导下，应用具有抑菌作用的洗发水，如煤焦油洗剂、二硫化硒洗剂、酮康唑洗剂等，有助于减轻头皮毛囊的炎症，促进皮损消退。
但需特别注意的是，部分抑菌洗发水不含表面活性剂，还可能有特殊气味，例如二硫化硒洗剂有较浓的硫磺味，导致使用时舒适度较低。对于这种情况，患者可在医生指导下，将抑菌洗发水和普通洗发水等比例混合使用，洗头时让泡沫在头皮停留数分钟后，再用清水冲洗， 也可起到一定抑菌作用，有助于促进头皮毛囊炎消退。
此外，如果患者不愿意应用抑菌洗发水，也可以先用温和、无刺激的普通洗发水来清洗头发和头皮，待吹干头发后，再遵医嘱外用莫匹罗星软膏、酮康唑乳膏等抗菌药物治疗，同样有助于促进头皮毛囊炎的消退。