长期适量喝酸枣仁，一般不会有明显副作用，个别人群会有过敏的情况。
酸枣仁属于安全性比较高的一味药材，很少产生不良反应，基于酸枣仁安全性较高的特点，目前，卫法监发[2002]51号文件，已经将酸枣仁列入药食同源类产品，因此，酸枣仁不仅可以入药，也可以日常食用，用来煲汤、熬粥或者制作成美味的药膳。
个别人群由于存在体质的差异，在食用酸枣仁后，可能出现过敏现象，常见表现为皮肤瘙痒、荨麻疹、口唇麻木、恶心呕吐等，这种情况需要立刻停止食用酸枣仁。过敏症状一般多可以在停用酸枣仁后自行消退。
需要注意，虽然酸枣仁安全性比较高，但如果是作为药材长期大量使用时，是一定要经过专业中医师辨证指导的。中医学认为，酸枣仁，性味甘酸平，归肝、胆、心经，具有养心益肝、安神、敛汗的功效，可以治疗心肝阴血亏虚所导致心慌、健忘、失眠、多梦、眩晕，以及异常出汗、口渴咽干等不适症状。而对于实热、食积、痰湿、湿热等实证所引起的失眠多梦者，食用酸枣仁并不对症，有时还可能导致症状加重，这种不良影响不属于副作用的范畴。
