辣椒吃多了肚子疼（即腹痛），可能是由于辣椒素、肠易激综合征、消化性溃疡等原因导致的，建议患者及时到医院消化内科就诊，由专业医生判断病因，并在医生指导下进行相应的治疗。
1、辣椒素：由于辣椒里面含有辣椒素，其对胃肠道黏膜有比较强的刺激作用，可能会导致胃肠道平滑肌痉挛，进而导致辣椒吃多了腹痛。这类患者一般无需治疗，但要注意调整饮食习惯，以清淡饮食为主，还可通过饮用温水、牛奶等来促进辣椒素代谢，从而缓解腹痛症状。
2、肠易激综合征：如果患有肠易激综合征，由于肠道黏膜比较敏感，容易受到辛辣食物的刺激，进而导致辣椒吃多了腹痛，可能还会出现腹泻、便秘等症状，有时腹泻和便秘可交替出现。这类患者需建立良好的生活习惯以及饮食结构，同时遵医嘱服用氢溴酸东莨菪碱片、匹维溴铵片、马来酸曲美布汀片等药物，来缓解疼痛。
3、消化性溃疡：如果患有消化性溃疡，辛辣食物会刺激溃疡面，进而导致辣椒吃多了腹痛，疼痛部位主要位于上腹部，还可伴有腹胀、嗳气、反酸、呕吐等症状。这类患者可遵医嘱应用抑酸药（如奥美拉唑钠肠溶片、兰索拉唑肠溶片、盐酸雷尼替丁片等）、抗酸药（如碳酸钙胶囊、复方氢氧化铝片、铝碳酸镁片等）、胃肠道黏膜保护药（如枸橼酸铋钾胶囊、胶体果胶铋胶囊）等药物进行治疗，必要时，还可通过手术切除溃疡部位。
4、其他原因：辣椒吃多了还可引起胃肠功能紊乱、急性胃肠炎、急性胰腺炎、急性胆囊炎等疾病，进而导致腹痛，应及时就医诊治。
综上所述，辣椒不宜过多食用，应根据自身情况把握摄入量，日常饮食应以清淡为主，可多吃蔬菜、水果、谷物、奶制品、瘦肉、鸡蛋、豆类等食物。