阴茎上有小水疱，可能与过敏、阴茎湿疹、包皮龟头炎、生殖器疱疹、尖锐湿疣等因素有关。
1、过敏：部分人群可因接触某些过敏原，比如食用了海鲜、坚果类食物，或者阴茎皮肤接触螨虫、人造纤维等，而引起机体的过敏反应，最终可出现阴茎皮肤过敏的表现。患者可在阴茎处见到小水疱，还可伴随局部皮肤红肿、瘙痒等表现。这种情况下，一般在去除过敏原后，症状可逐渐缓解。瘙痒症状明显者，也可在医生指导下，服用西替利嗪、氯雷他定等药物，以缓解症状。
2、阴茎湿疹：如果患者未注意私处卫生、未及时更换内裤等，可造成阴茎长期闷热潮湿，从而引起阴茎湿疹。阴茎处可见到水疱或红色丘疹，还可伴随瘙痒、皮肤破损、液体渗出等表现。此类患者可在医生指导下，局部外涂曲安奈德乳膏、糠酸莫米松乳膏等糖皮质激素，以缓解症状；还应尽量减少外界刺激因素，比如热水烫洗、过度抓挠等。
3、包皮龟头炎：包皮龟头炎是指阴茎包皮和阴茎头发生肿胀和炎症反应，可因病原体感染（比如细菌、真菌、病毒等）、生殖器部位外伤、避孕套刺激等多种原因所致。除了阴茎水疱外，局部还可见溃疡、丘疹、红肿等，并伴瘙痒等不适。此类患者临床以药物治疗为主，可根据患者情况，局部外用甲硝唑、替硝唑等抗生素类药物，或者制霉菌素、酮康唑等抗真菌药物；合并包皮过长者，可考虑进行包皮环切术。
4、生殖器疱疹：生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒（HSV）感染，引起的一种性传播疾病。可在阴茎等处见到水疱样皮损；随着病情发展，水疱可破溃，形成糜烂或溃疡；还可伴阴茎局部瘙痒、疼痛、烧灼感，以及发烧、头痛、肌肉酸痛等类似流感样的症状。此类患者可在医生指导下，局部外涂喷昔洛韦乳膏、阿昔洛韦乳膏等抗病毒药物，或用硼酸洗液适当清洗局部；病情较重者，还可配合口服阿昔洛韦、伐昔洛韦等药物，以缓解症状。
5、尖锐湿疣：尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染，引起的一种性传播疾病。发病之初，可在阴茎等处见到淡红色小丘疹，丘疹上可能会出现水疱；之后丘疹逐渐增多，可发展为乳头样或菜花样赘生物，并伴随灼痛、瘙痒等表现。此类患者临床以药物治疗为主，可遵医嘱局部外用鬼臼毒素酊、咪喹莫特乳膏等，也可全身应用转移因子、胸腺素等；症状较重者，还可采取激光治疗、冷冻治疗、光动力治疗等方式，以促使水疱尽快结痂。
6、其他因素：部分患者还可因梅毒、毛囊炎等疾病，累及阴茎后，而造成阴茎小水疱。此类患者需积极治疗原发病。
综上，阴茎上有小水疱的原因比较复杂，建议患者及时去医院男科或皮肤科就诊，并遵医嘱进行阴囊体格检查、病原学检查、皮肤斑贴实验、病理检查等，以明确病因，从而在医生指导下进行干预。
