生殖器上长痘痘的原因较多，多见于女性假性湿疣、男性珍珠状阴茎丘疹、毛囊炎、生殖器疱疹、尖锐湿疣、包皮龟头炎、疥疮等情况，不同原因的消除方法也不尽相同。
1、女性假性湿疣：为女性特有的一种外阴黏膜生理变异，痘痘多位于小阴唇内侧，对称分布，为排列整齐、透明、鱼籽样的小丘疹，直径1~3mm左右，无自觉症状，容易与尖锐湿疣相混淆。本病属于一种良性的生理变异，通常无需治疗，部分可在更年期后自愈，无需过分担心。
2、男性珍珠状阴茎丘疹：为男性特有的一种生理变异，主要表现为围绕阴茎冠状沟的珍珠状丘疹，直径约 2~3mm，通常无自觉症状。本病也不会影响健康，一般无需治疗。
3、生殖器毛囊炎：为常见的毛囊炎症性皮肤病，主要由细菌感染所致，男性皮疹多位于阴茎根部，女性多位于大阴唇外侧和阴阜等毛囊部位，起初表现为红色的炎性丘疹，随后可发展为脓疱疹，伴瘙痒或疼痛。针对这种情况，应注意个人卫生，保持会阴部清洁、干燥，勤洗澡，勤换内衣裤，同时可以外用夫西地酸乳膏、环丙沙星软膏等进行治疗。
4、生殖器疱疹：为常见的性传播疾病，是由单纯疱疹病毒感染所致，男女均可发病，男性多位于阴茎头、冠状沟等部位，女性多位于阴道口、肛门周围，起初表现为单个或多个丘疹，随后形成成簇的小水疱，可伴腹股沟淋巴结肿痛、发热等全身症状。针对这种情况，主要使用喷昔洛韦乳膏、泛昔洛韦片等进行抗病毒治疗，同时，男女双方均应接受治疗。
5、尖锐湿疣：是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的常见性传播疾病，男女均可发病，发病前3个月左右常存在不洁性交史，男性多位于阴茎头、冠状沟、包皮系带、尿道口等部位，女性多位于大小阴唇、阴道口、阴蒂等部位，起初为淡红色柔软的小丘疹，随后可逐渐增大、增多，部分融合而形成乳头状、菜花状或鸡冠状。针对这种情况，应采取药物治疗（比如咪喹莫特乳膏）、物理治疗（比如激光、冷冻）、手术治疗（比如高频电刀切除）等综合治疗，以达到去除局部疣体、改善临床症状、减少复发的目的。
6、其他：包括包皮龟头炎、疥疮、皮脂腺异位症、梅毒等，也可导致生殖器出现痘痘样皮损，并且可能与上述疾病相混淆。针对这种情况，应明确诊断后，采取有针对性治疗。
需要提醒的是，生殖器上长痘痘，既可能是正常生理变异，也可能是普通的皮肤感染，还可能是性传播疾病，情况比较复杂，建议患者应前往正规医院皮肤科，完善醋酸白试验、HPV检测、皮肤病理活检等检查，明确诊断，积极干预，避免误诊、误治。