明目地黄丸不能长期吃，虽说本品具有滋肾，养肝的作用，为补益类药物，但是药三分毒，长期吃反而会给身体带来伤害。
一般来说，服用明目地黄丸的疗程会相对长一些，根据病情严重程度，从服药几周到数月不等，自行用药2周后若病情仍不见好转，可能是用错了药物，建议咨询医生，不宜盲目长时间用药。对于用药周期较长的患者来说，应该定期到医院复诊，监测病情。
另外，从不良反应方面来讲，明目地黄丸中含有很多滋补类药物，如熟地黄、山药、枸杞子等，这些药有滋腻碍胃的特点，简单来说就是减慢胃动力，长期服用，这种副作用会更加明显，出现腹胀、不消化、食欲减退、排便不畅等问题。所以，不宜长期服用明目地黄丸。