保婴丹和八宝惊风散都为儿科用药，两者在成分、功效应用、处方特点上有所不同。
成分上，保婴丹和八宝惊风散含有一些相同的成分，如天麻、冰片、珍珠、金礞石、天竺黄、防风、川贝母、全蝎等，保婴丹还含有一些特殊的成分，如麻黄、琥珀、郁金、重楼、黄连、蝉蜕等，而八宝惊风散也含有黄芩、沉香、丁香、茯苓等其他成分。
功效应用上，保婴丹和八宝惊风散都有一定镇惊的作用，但保婴丹擅于疏散风热、调节肠胃、化痰定惊，可治疗小儿外感风寒、食滞化热引起的发热恶寒、喷嚏流涕、咳嗽有痰，及不思饮食、夜啼易惊等症。而八宝惊风散退热力较强，能祛风化痰、退热镇惊，可用于治疗小儿痰热内蕴引起的急热惊风、发烧咳嗽、呕吐痰涎。
处方特点上，保婴丹属于非处方用药，患者可自行购买给宝宝服用。而八宝惊风散属于处方药，患儿应在医生的指导下服用。用药期间若病情未好转或出现其他不适，应及时咨询医生。