补益资生丸具有滋阴补气、调养脾胃的功效。一般用于治疗脾胃虚弱引起的胸闷作呕、食欲不振、精神倦怠、大便溏泄。以下为本品的药物合用禁忌：
1、本品含有人参，根据中药“十八反”配伍禁忌（诸参辛芍叛藜芦）可知，本品不宜与藜芦及含有藜芦的中成药合用，如神州跌打丸、三七血伤宁胶囊等，否则可能会发生毒性反应或副作用。
2、本品含甘草，不宜与海藻、大戟、甘遂、芫花或其制剂合用，如乳癖消片（含海藻）、祛痰止咳颗粒（含甘遂、芫花）、舟车丸（含大戟、甘遂、芫花）。这属于中药“十八反”的合用禁忌范畴，这几种药物同用，可能会发生毒性反应或副作用。
3、本品含有山楂，其含有大量有机酸，所以本品不宜与碱性较强的药物合用，如氨茶碱、胃舒平、碳酸氢钠片等，两者合用可发生酸碱中和反应，降低药物疗效。
4、本品含有黄连，其属于生物碱类中药，与酶制剂（胃蛋白酶、乳酶生、胰酶、多酶片、淀粉酶）、金属盐类（碳酸钙、氯化钾、硫酸亚铁、次碳酸铋、枸橼酸铁铵糖浆等）、碘及碘化物（碘化钾、碘化钠、碘喉片）合用会生成难溶物而影响药效，因此本品不宜和上述药物合用。
5、本品和其他药物合用，也可能发生药物相互作用，降低药物疗效或增加毒副作用。因此，为确保安全用药，患者用药期间如需合用任何其他药物，请务必先咨询医生，不可擅自合用。