目前还没有充足的证据能证明HPV疫苗能够终身免疫。根据现有研究，HPV疫苗的效力可以维持十年以上。
由于HPV疫苗临床应用的时间并不长，其最初上市时间为2006年，距今也就十多年，所以关于HPV疫苗的长期保护效果尚不明确，长期随访仍在继续。根据目前最长的临床跟踪随访发现，部分患者接种疫苗已达十年以上，但免疫效果依旧有效，并不需要补打疫苗。由此可见，HPV疫苗的效力维持时间可达十年以上。
需要注意，要想获得长期免疫，受种者应严格遵医嘱注射三针HPV疫苗。每针HPV疫苗的作用是不同的，接种HPV疫苗第一针后，可诱导机体免疫系统识别病毒，并产生相应的抗体；间隔2个月接种第二针，可激发机体免疫系统，产生大量抗体；间隔6个月接种第三针，可以起到加强免疫的作用，能使产生的抗体效价更高，预防效果更为持久。
另外，除了正确认识HPV疫苗的效力维持时间，还应正确认识HPV疫苗的预防范围。现有的HPV疫苗，只能针对部分HPV亚型发挥预防作用，而目前已知HPV有150余型，所以HPV疫苗不能预防所有HPV感染。完成了HPV疫苗接种的人群，仍需要定期进行宫颈癌筛查，日常生活中应注意洁身自好，避免高危性行为。