建议在孕期注射百日咳疫苗的原因是降低新生儿出生后感染百日咳杆菌的风险。
百日咳是由百日咳杆菌引起的急性呼吸道传染病，病程较长，未经治疗，咳嗽症状可持续2～3个月。目前发现新生儿感染百日咳杆菌后，病情较重，可引发支气管肺炎、肺不张、百日咳脑病等并发症，甚至导致新生儿死亡。因此，国际组织建议孕期（孕中期或晚期）注射百日咳疫苗，使孕妇获得抗体，并将抗体传递给胎儿，以降低新生儿出生后感染百日咳杆菌的风险。
需要提醒的是，目前百日咳疫苗多为“百白破”三联制剂疫苗，除百日咳，对白喉和破伤风也有预防作用。有条件者可在孕期或产后酌情进行“百白破”疫苗接种，通过母亲将抗体传递给婴幼儿，以预防婴幼儿感染百日咳杆菌。此外，新生儿出生后，应及时注射百白破疫苗，一般于出生后3、4、5月龄分别接种一次，于18~24月龄再接种一次加强针，以加强免疫。