如果被诊断为习惯性流产，则患者应及时前往正规医院妇科、生殖医学科等科室就诊，通过染色体核型分析、盆腔超声、免疫学检查、甲状腺功能测定等检查，查明具体原因，然后采取针对性治疗措施，以尽量避免再次妊娠时而发生流产。
1、对于染色体异常或基因缺陷引起者，虽然目前暂无有效治疗方案，但可在妊娠前进行遗传咨询，了解再次妊娠发生染色体异常的概率以及临床上的选择，从而帮助作出决定。
2、对于子宫解剖结构异常引起者，则应根据实际病变情况采取相应的治疗方法。例如宫腔粘连者，可进行宫腔镜粘连分离术，术后放置宫内节育器，防止再次粘连，或术后使用雌激素治疗，以促进子宫内膜再生、修复，恢复生育能力。
3、对于免疫功能异常引起者，则应根据具体的病情，确定合适的治疗方案。例如抗磷脂综合征患者，可遵医嘱应用阿司匹林、低分子肝素等药物进行治疗。
4、对于血栓前状态引起者，可遵医嘱应用阿司匹林、低分子肝素、叶酸等药物进行治疗，若相关异常指标恢复正常，即可停药。
5、对于内分泌因素引起者，则应根据异常指标进行相应的处理，将内分泌代谢功能控制在合适范围，以减少不良妊娠的风险。比如甲状腺功能减退症患者，可遵医嘱应用甲状腺激素进行治疗，在甲状腺功能恢复正常3个月后再考虑妊娠，并在妊娠期间坚持服用甲状腺激素。
6、对于感染因素引起者，则应根据病原体的类型采取相应的抗生素治疗，比如细菌感染者可应用克林霉素等。
习惯性流产患者在病因解除后，如果顺利怀孕，则在怀孕期间，通常需尽早应用黄体酮进行保胎。如果在怀孕40天左右进行超声检查时，发现胚胎发育正常，则可继续应用黄体酮保胎至妊娠12周；如果超声检查提示胚胎发育不良，则可能需要终止妊娠，以免严重危害母体健康或生下有缺陷的胎儿。
需要提醒的是，习惯性流产的病因十分复杂，因此，建议夫妻双方在积极治疗的同时，还应保证健康的生活方式，比如规律作息、放松心情、积极锻炼等，以帮助提高整体的生育能力。