纵隔子宫主要的危害在于对生育功能的影响。
纵隔子宫是先天性发育异常所致的一种子宫畸形，患者中有30%~40%的人可能出现不孕、早产、流产等情况，这类患者需到有成熟诊治技术的医院进行手术治疗。纵隔子宫目前最主要的手术方式，是在腹腔镜监视下通过宫腔镜切除纵隔，手术简单、安全、微创，通常手术后3个月即可妊娠，妊娠结局良好。如果纵隔较厚，一次无法完整切除，也可酌情进行二次手术。
但如果纵隔子宫不影响患者的正常生育，能使患者正常怀孕及足月分娩，则一般不需要治疗处理，遵医嘱定期复查，观察病情变化即可。
需要注意，由于纵隔子宫并不多见，且容易与其他疾病混淆，并不是每个医院、每个医生都能遇到这样的病例和积累相关的诊治经验，因此非常容易发生误诊误治的情况，建议患者尽量前往有成熟诊治技术的大型正规医院妇科就诊，请经验丰富的医生进行妇科检查、超声、宫腔镜等相关检查，以明确诊断，必要时遵医嘱积极进行治疗，以获得较好治疗效果。