感染过HPV可以打疫苗，疫苗虽然没有治疗效果，但仍有一定预防效果。
HPV疫苗可以预防多种HPV亚型感染，即使已感染过某种HPV，此时打疫苗对于未感染的HPV类型仍然具有预防效果，同时也可以预防同种HPV亚型的再次感染。但疫苗对已发生的感染并没有治疗效果，所以通常建议先控制感染，待HPV检测转为阴性后再接种疫苗。
对于未出现明显病变的患者，可以通过适当运动、补充营养、减少压力等方法增强免疫力，依靠自身免疫反应清除HPV病毒，必要时可遵医嘱使用抗HPV生物蛋白敷料、红色诺卡氏菌细胞壁骨架、干扰素或一些阴道栓剂等增强局部抵抗力，进行辅助治疗。
对于已出现皮肤、宫颈等区域病变的患者，需要根据具体病情选择治疗方法。例如感染了高危型HPV，出现子宫颈鳞状上皮内病变的患者，如果病变级别较低，可先观察随访，待其自然消退；如果病变持续发展或长期存在超过2年，则有癌变可能，需要采取治疗措施，通常采用子宫颈锥切术、冷冻或激光消融治疗，必要时也可行子宫切除术。
需要提醒的是。对于已感染HPV的患者，即使感染好转，完成了HPV疫苗接种，仍需要定期进行宫颈癌筛查，日常生活中要洁身自好，避免高危性行为。