安全期怀上的孩子一般是正常的。
通常把女性排卵前3天甚至5天之前的时间段，和排卵3天以后的这一段时间，称为安全期。从理论上讲，如果在安全期内同房，女性怀孕的几率会比较低。但事实上，正常女性的排卵时间受较多因素的影响，单纯按照月经周期计算得出的排卵时间不一定准确。如果女性在所谓的“安全期”发生排卵时进行性生活，那么可能导致避孕失败，从而意外怀孕。
因此，在安全期怀孕往往也是正常排卵受孕，在此期间怀上的孩子一般无明显异常。但如果女性在这段时间内，使用药物治疗阴道炎、呼吸道感染等疾病或者是接触放射线等有毒有害物质，那么可能会对胎儿的生长发育产生一定的不良影响。
如果在安全期意外怀孕，一般建议明确近期是否服用孕期禁用药物、是否接触有毒有害物质等，并及时到医院进行孕前检查，由医生综合评估后考虑是否继续妊娠。