输卵管囊肿可能会影响怀孕。当囊肿影响输卵管功能时可能会影响怀孕，严重时可以导致不孕、异位妊娠等情况发生。
输卵管囊肿主要与炎症反应有关。炎症可以引起输卵管局部出现肿胀、渗出、输卵管伞端闭锁，导致输卵管发生积水或积脓，在炎症消退后，脓液等坏死物质被机体吸收后，由于管腔被扩大，在局部可以形成内容物为清亮液体的囊肿。
如果囊肿较大，可能影响患侧输卵管捡拾卵子、运输卵子和受精卵的功能，从而影响正常受孕及受精卵正常着床。如炎症反复发作，影响双侧输卵管功能时，则可能导致不孕、异位妊娠的发生。
建议存在输卵管囊肿的患者，及时到妇科就诊，完善妇科查体、血常规、妇科B超等检查，由专科医生明确诊断并确定治疗方案。在日常生活中，注意保持个人卫生、减少不必要的手术，可以减少炎症反应，有效降低输卵管囊肿的发生率。同时，保持规律的作息、合理的饮食习惯、避免过度劳累及过大压力，有利于提高机体抗病能力，从而减少输卵管囊肿的发生，避免影响女性生育功能。