预防巴氏腺囊肿的措施主要包括做好外阴清洁、选择合适的内裤、注意性生活卫生保健、避免外阴损伤等。
外阴损伤，或者细菌等病原体所致的外阴局部炎症，均可能导致巴氏腺腺管开口部阻塞，致使分泌物积聚于腺腔，从而形成巴氏腺囊肿，日常避免相关不良因素，有助于预防疾病发生。
1、做好外阴清洁：保持外阴部干净、卫生，勤洗澡，特别是性生活后要注意外阴清洁，可用纸巾或卫生湿巾将外阴部的分泌物擦拭干净或者是用清水清洗外阴，从而避免局部感染，预防外阴局部炎症的发生，进而达到预防巴氏腺囊肿的目的。
2、选择合适的内裤：穿宽松、透气的纯棉内裤，每天及时更换，不穿过紧的内裤；内裤清洗后，最好在阳光下晾晒。
3、注意性生活卫生保健：比如进行性生活时规范使用避孕套、限制性伴侣数量等，尽可能减少外阴感染的发生。
4、避免外阴损伤：平时要注意人身安全，避免外阴部损伤，从而达到预防巴氏腺囊肿的目的。
5、其他：对于已经发生外阴局部炎症的患者，特别是前庭大腺炎，应及时到妇科就医，应用抗生素治疗，以免病情进展而形成巴氏腺囊肿。
值得提醒的是，巴氏腺囊肿如果没有症状，可定期随诊观察，无需治疗。但如果囊肿较大，影响外观、有明显的不适症状或者是反复发作、有感染征象，患者应及时到妇科就医，进行妇科查体、分泌物检查等，以明确病情，并积极进行治疗。