宫颈柱状上皮异位可以自愈。
宫颈柱状上皮异位是阴道镜下描述子宫颈管内柱状上皮外移至子宫颈阴道部的术语。临床上，子宫颈管表面覆盖有单层柱状上皮，子宫颈阴道部由复层鳞状上皮覆盖，表面光滑，两者交界部位多位于宫颈外口，称为宫颈鳞柱交界部。但是，此交界区并不恒定，容易受到体内雌激素的影响。当体内雌激素水平较高时，则宫颈柱状上皮可向外扩展，占据一部分宫颈阴道部，从而形成宫颈柱状上皮异位，这是一种正常的生理现象。
具体来讲，当新生女婴在母体内受到高雌激素影响时，柱状上皮向外扩展，占据一部分宫颈阴道部；当幼女期，由母体来的雌激素作用消失后，柱状上皮退至宫颈管内；青春期和生育期，尤其是妊娠期，雌激素增多使柱状上皮又外移至宫颈阴道部；绝经后雌激素水平低落，柱状上皮再度内移至宫颈管。由此可见，宫颈柱状上皮异位是可以自愈的。
需要提醒的是，宫颈柱状上皮异位的女性可出现宫颈糜烂样改变，是由于宫颈柱状上皮菲薄，其下间质透出，呈红色，肉眼看似糜烂，但并非病理学上所指的上皮脱落、溃疡的真正性糜烂，而子宫颈鳞状上皮内病变（SIL）以及早期宫颈癌，也可使宫颈呈糜烂样改变，因此，对于宫颈糜烂样改变者，需进行子宫颈细胞学检查和（或）HPV检测，必要时需行阴道镜及活组织检查，以除外SIL或宫颈癌。