子宫内膜薄不来月经的患者，需要及时到正规医院妇科就诊，完善妇科体格检查、激素水平检测、超声检查等，由专科医生明确诊断，并制定合理的治疗方案。目前常用治疗方法包括药物治疗、盆底神经肌肉电刺激、手术治疗等；对于有原发疾病的患者者，还需积极治疗原发疾病，才能提高疗效。
1、药物治疗：患者可遵医嘱使用激素类药物，例如戊酸雌二醇、黄体酮、地屈孕酮等，有助于促进子宫内膜修复及增厚，进而促使月经来潮。有研究表明，低剂量阿司匹林、己酮可可碱等药物，可以促进子宫内膜血管生成，改善局部血流，致使子宫内膜增厚，进而促使月经来潮。此外，部分患者还可在专业中医师的指导下酌情服用乌鸡白凤丸、调经丸等中成药。
2、盆底神经肌肉电刺激：电刺激可以使盆底肌肉收缩和舒张，促进盆底血液循环，增加内膜及内膜下血流灌注，促进内膜生长，进而促使月经来潮。
3、手术治疗：主要是子宫内膜微刺激术，其是指通过对子宫内膜的局部机械性损伤，诱导其自身修复，进而改善子宫内膜薄不来月经的情况。
4、积极治疗原发病：对于存在原发疾病的患者，在接受上述治疗的同时，还需积极治疗原发疾病，才能从根本上解决问题。例如子宫内膜结核患者，应在医生指导下服用抗结核药物，比如异烟肼、利福平等，必要时需行手术治疗；子宫内膜炎患者，应在医生指导下服用抗生素，一般选择广谱抗生素或联合用药，包括头孢噻肟、克林霉素、甲硝唑等。
5、其他：有研究表明，高压氧治疗、干细胞移植等，对于子宫内膜薄不来月经也有一定的治疗作用。
需要注意的是，患者在进行专业治疗的同时，还要注意个人卫生，同时要保持健康的作息习惯，避免熬夜；适当运动增强体质，以促进康复；在饮食上，要多吃绿叶蔬菜和水果，比如菠菜、芹菜、香蕉等，并注意蛋白质的补充，可适当摄入肉、蛋、奶制品、大豆及坚果等。