子宫内膜不典型增生的治疗方式，需依据患者是否有生育要求及年龄决定。对于有生育要求、年轻的患者，一般建议选择药物治疗，而对于无生育要求、年龄较大的患者，则建议选择手术治疗。
一、药物治疗。
- 1、孕激素：孕激素是药物治疗的首选药物，可以抑制子宫内膜生长，常用药物包括醋酸甲地孕酮、醋酸甲羟孕酮等。
- 2、促性腺激素释放激素激动剂：主要适用于肥胖、肝功能异常等孕激素治疗有禁忌或孕激素治疗无效的患者，可单独使用或联合含左炔诺孕酮的宫内节育系统使用。常用药物有醋酸曲普瑞林、戈那瑞林等。
二、手术治疗。
- 由于药物治疗有较高的复发率，并且子宫内膜不典型增生有14%~30%左右的概率会发展为子宫内膜癌，同时合并子宫内膜癌的比例也很高。因此，如果患者没有生育要求，全子宫切除术是该病的治疗首选，一般不建议进行内膜切除术。此外，绝经前女性是否同时切除双侧卵巢应个体化处理，但推荐双侧输卵管切除，这样可减少以后发生卵巢癌的风险。
需要注意的是，对于选择药物治疗者，需要每三个月清宫一次，如果三个月或者半年以后，子宫内膜不典型增生逆转成正常的子宫内膜，此时医生会鼓励患者到生殖医学科进行辅助生育。