输卵管妊娠的危害主要是会引起腹痛不适、失血性休克，还会增加异位妊娠风险，影响正常妊娠，并给女性带来心理创伤。
1、腹痛不适：输卵管妊娠时，由于胚胎在输卵管内逐渐增大，常表现为一侧下腹部隐痛或酸胀感。当发生输卵管妊娠流产或破裂时，可突感一侧下腹部撕裂样疼痛。
2、失血性休克：如果输卵管妊娠患者发生输卵管破裂，且出血量较多，可能会出现晕厥、面色苍白、四肢发冷、脉搏细弱、血压降低等休克症状，严重时甚至会危及生命。
3、增加异位妊娠风险：发生过输卵管妊娠后，未来再次发生异位妊娠的风险可能会高于正常人群。
4、影响正常妊娠：对于病情比较危急、凶险、出血量特别大的输卵管妊娠患者，医生可能会建议行患侧输卵管切除术，这样就丧失了一侧输卵管，理论上来讲，以后发生妊娠的几率会减半。另外，即使采取保守手术，即“切开取胚”的手术方式，患侧输卵管也会不可避免的被破坏，这样也会对未来再次妊娠产生一定影响。
5、给女性带来心理创伤：输卵管妊娠会对女性的心理造成较大的伤害，可能会导致其出现焦虑、紧张、忧郁、失望等不良情绪，并害怕再次妊娠。
鉴于输卵管妊娠具有较大的危害，因此，一旦被查出有输卵管妊娠，建议及时去正规医院妇科或产科就诊，遵医嘱完善妇科查体、人绒毛促性腺激素（hCG）检测、超声检查等明确具体病情，然后积极配合医生进行治疗，切不可拖延，以免导致不可挽回的后果。