阴蒂肥大一般不会有太大的危害，但肥大程度比较严重者，则可能会引起局部不适、心理问题、性生活障碍以及炎症感染等问题，从而对女性的身体和心理健康产生一定危害。
1、局部不适：阴蒂肥大是指阴蒂超过正常大小，患者在日常行走过程中，可能会由于阴蒂受到内裤摩擦而感到不适、疼痛。
2、心理问题：患者可能会由于阴蒂过长、粗大，甚至像阴茎一样，而感到焦虑、抑郁、自卑。
3、性生活障碍：患者可能会由于性生活时阴蒂过于敏感，而使性生活更容易达到高潮，甚至产生疼痛、出血等情况，从而降低性生活质量。
4、炎症感染：患者可能会由于阴蒂更容易受到内裤摩擦而出现破损，受到阴道分泌物刺激后，可能发生炎症感染，并伴有刺痛等症状。
需要提醒的是，如果阴蒂肥大患者没有任何症状，则一般不需要治疗，但如果出现不适症状，则建议前往正规医院的妇科、内分泌科就诊，通过妇科常规检查、激素测定、B超等手段确定原因，然后积极治疗原发疾病，并可通过手术进行整形，一般手术后阴蒂的外观和功能都可得到良好的恢复。