艾司奥美拉唑镁肠溶胶囊用于治疗胃食管反流病（GERD )、与适当的抗菌疗法联合用药根除幽门螺杆菌、需要持续NSAID治疗的患者。以下为本品的一些禁忌：
一、禁忌事项：
1、已知对艾司奥美拉唑、其它苯并咪唑类化合物或本品的任何其他成份过敏者禁用。
2、使用艾司奥美拉唑镁后发生超敏反应，如：速发过敏反应、过敏性休克、血管性水肿、支气管痉挛、急性间质性肾炎和荨麻疹的患者禁用本品。
3、孕妇应在医生指导下慎用本品。哺乳期妇女和儿童不应使用本品。
4、本品含有蔗糖。伴有罕见的遗传性疾病，如果糖耐受不良、葡萄糖-半乳糖吸收障碍或蔗糖酶-异麦芽糖酶不足的患者，不可服用本品。
二、禁忌事项：
1、艾司奥美拉唑可能与多种药物发生药物相互作用，合并用药需谨慎。
2、当患者出现任何报警症状（如显著的非有意的体重减轻、反复呕吐、吞咽困难、呕血或黑便）、怀疑有胃溃疡或已患有胃溃疡时，应首先排除恶性肿瘤，因为使用本品治疗可减轻症状，延误诊断。
3、在服用包括艾司奥美拉唑镁在内的PPIs的患者中观察到急性间质性肾炎。急性间质性肾炎可能发生在PPI治疗期间的任何时候，并且通常归因于特发性过敏反应。如果急性间质性肾炎发展，则停止服用本品。
4、对于接受高剂量治疗（定义为每日多次服药）和长期（1年或更久）PPI治疗的患者，发生骨折的风险也会增加。患者应当根据病情接受最低剂量和最短疗程的PPI的治疗。