男性支原体感染应该根据自身情况挂呼吸内科、泌尿外科或者男科。支原体是介于细菌和病毒中间的一种原核微生物，目前确定对人类有致病性的支原体有4种，包括肺炎支原体、人型支原体、生殖支原体和解脲脲原体。
1、呼吸内科：肺炎支原体感染者，可出现咽痛、鼻塞、剧烈干咳等呼吸道症状，此类患者应该挂呼吸内科，由呼吸内科的医生进行专业的评估和诊断。
2、泌尿外科或男科：人型支原体、生殖支原体和解脲脲原体感染者，主要出现泌尿生殖道症状，比如尿道刺痛、尿频、尿急、尿道口有分泌物等，此类患者应该挂泌尿外科或男科。
怀疑存在支原体感染时，男性应视情况不同，及时前往上述科室就诊，医生会针对具体情况，开具血常规、血清支原体IgM抗体、支原体核酸扩增试验等检查，以明确诊断。确诊后，遵医嘱服用抗菌药物，并接受对症治疗。