大部分尿道下裂患者需要进行手术治疗，只有少部分尿道裂口接近阴茎顶端，且阴茎的形态和功能没有明显异常的患者，可以遵医嘱定期观察。
对于经专科医生明确诊断为尿道下裂的患者，需根据病情不同，采用尿道成形术和阴茎弯曲矫正术等方法进行治疗。通过建立新的尿道、纠正阴茎畸形，从而恢复正常的排尿功能和阴茎勃起、射精功能，避免因排尿姿势异常、阴茎外形及功能异常而给患者的生活质量、心理健康及生育功能造成影响。
由于患儿在3岁以内阴茎增长幅度较小，且记忆不强，因此尿道下裂的患儿宜在6~18个月内进行手术。如果患者年龄过大，则修复尿道的阴茎皮肤会比较少，可能会增加手术操作的难度，以及术后感染等并发症的发生风险。
需要注意的是，由于尿道下裂是一种先天性泌尿生殖系统畸形，因此患者的病情往往存在差异。建议可能存在尿道下裂的患者，及时到正规医院的泌尿外科、儿科就诊，配合专科医生完成专科查体、影像学检查、染色体检查等，从而明确诊断并尽早开始治疗，同时术后应遵医嘱做好术后护理及定期复查，以获得最佳的治疗效果。