男性输精管结扎的影响主要在于失去生育功能、可能导致附睾淤积症，以及可能对心理产生不利影响。
1、失去生育功能：在输精管结扎术中，医生会在阴囊两侧皮肤上各做一个小切口，经此进入阴囊，然后将输精管切断并结扎。输精管结扎一段时间后，新产生的精子不能再通过输精管到达精液中，也不能再和卵子相遇，会使男性失去生育功能。
2、导致附睾淤积症：输精管结扎以后，睾丸生成的精子以及附睾产生的附睾液无法通过输精管排出体外，部分男性会发生附睾淤积症，表现为附睾胀痛、肿大并有压痛，在长时间站立、行走或性交后症状会更明显。
3、对心理产生不利影响：输精管结扎术是一种持久性节育措施。少数男性在结扎后可能因为后悔而产生困扰，或者因为担忧影响性功能而焦虑，久而久之会对心理产生不利影响。
在临床上，输精管结扎相对来说属于比较安全的手术，一般没有太多后遗症，相比女性输卵管结扎更容易实施，是一种值得推广的避孕方式。