传染性软疣能够自愈，但自愈时间很长。
传染性软疣是传染性软疣病毒感染所引起的疾病，具有自愈的可能性，体内的免疫系统将病毒全部清除后，软疣可以自行消失，但是需要的时间比较长。国内外有些文献报道，传染性软疣的自愈时间从几个月到几年不等，部分患者甚至长达5年才能痊愈。
需要注意的是，传染性软疣具有传染性，在自愈前的这段时间内，都可能传染给周围的人，尤其是孩子、老人等免疫力比较低的个体；传染性软疣还可以自体传播，会导致患者身上的疣体越来越多。因此建议诊断明确的患者，及时前往正规医院皮肤科就诊，然后在医生的指导下进行检查、治疗，不要等待其自愈。
传染性软疣的治疗方式主要包括药物治疗、物理治疗、手术治疗等，药物治疗主要使用水扬酸软膏、维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等药物，物理治疗主要包括冷冻、激光、电灼等方式，手术治疗可以通过夹除术或刮除术去除皮损。