掌跖脓疱病的治疗以应用抗炎药物为主，另外，由于患者常可出现皮肤角化过度的表现，所以还需配合应用调节角化的药物进行治疗。此外，光化学疗法也有助于改善症状。
1、抗炎药物：对于局限性皮损，外用糖皮质激素是公认的一线治疗方法，常用的药物有卤米松乳膏、丁酸氢化可的松乳膏等。皮损广泛者，在进行外用药物治疗的同时，还需在医生指导下口服免疫抑制剂（如甲氨蝶呤片）、秋水仙碱片、雷公藤多苷片、昆明山海棠片等药物，从而提高治疗效果。
2、调节角化的药物：患者可遵医嘱外用维A酸乳膏、煤焦油软膏、他卡西醇软膏，或者是口服阿维A胶囊等药物，来改善皮肤过度角化的现象。
3、光化学疗法：患者先服用补骨脂素，然后用紫外线A段光照射皮损区域，有助于缓解症状。
需要提醒的是，由于本病的发生可能与过敏、感染等因素有关，因此患者应尽量避免接触可能导致过敏或者感染的因素，比如在工作、劳动过程中，可以通过戴手套、接触污染物质（如灰尘、重金属、消毒剂等）后洗手、洗手后涂抹保湿霜等方法，对掌跖部位进行保护，防止诱发或加重皮肤损害。
