性连锁鱼鳞病是由于X染色体上编码类固醇硫酸酯酶（STS）的基因发生异常而引起的，多数由STS基因大段缺失导致，约10%与STS基因发生点突变有关。STS基因突变，可导致角质层类固醇硫酸酯增多，影响角质层细胞正常脱落而形成鳞屑。
性连锁鱼鳞病属于单基因遗传的X连锁隐性遗传病。正常情况下，男性的性染色体组成为XY，女性为XX。由于男性只有一条X染色体，而女性有两条X染色体，当一条X染色体异常时，另一条X染色体则可以替代其功能。所以该病好发于男性，女性发病少见，多为致病基因携带者。
对于存在性连锁鱼鳞病家族史者，可以在怀孕前进行基因检测，以确定自身是否携带致病基因。如果确定了携带致病基因且生育愿望比较强烈，可以考虑采用辅助生殖技术，对胚胎的基因进行检查，筛选出不携带致病基因的胚胎进行移植，从而降低后代患病的可能。
