遗传性对称性色素异常症最主要的症状为皮肤出现异常色素改变，包括色素加深和色素减退。
遗传性对称性色素异常症主要表现为形状和大小不规则的色素沉着和色素减退网状斑，通常为针尖至黄豆大小的黄褐色、黑褐色斑，互相之间不融合，并间杂有色素减退斑点，表现类似雀斑。皮损常对称散布于手背、足背等肢端，也可累及小腿或者上肢的部分区域，有时还可波及颈、锁骨上部、面部及口腔黏膜。夏季日晒后，可导致皮损加重、颜色变深。
遗传性对称性色素异常症多在婴儿期起病，青春期症状变明显，进展缓慢，可持续终生。一般来说，遗传性对称性色素异常症不会引起自觉症状，不会产生危害，不需要进行治疗，注意夏季防晒即可。少数患者可能会合并掌跖角化症、神经纤维瘤病、特发性变应性肌张力障碍、特发性脑钙化等病变，应前往正规医院皮肤科就诊，在医生的指导下进行治疗。