甲硝唑胶囊为处方药，具体的用药剂量、用药疗程等应听从医师的安排。就诊时，要详细向医生描述自己的特殊过敏史、身体状况、基础疾病以及近期用药情况等，以排除用药禁忌，减少用药风险，并制定个体化的治疗方案。
肝功能减退者中，本品的代谢减慢，药物及其代谢物易在体内蓄积，应减量使用，并作血药浓度监测。患者用药期间不应饮用含酒精的饮料，因可引起体内乙醛蓄积，干扰酒精的氧化过程，导致双硫仑样反应，患者可出现腹部痉挛、恶心、呕吐、头痛、面部潮红等。患者在使用本品过程中出现中枢神经系统不良反应时，应及时停药。
患者使用本品治疗阴道滴虫病时，其性伴侣需同时进行治疗。治疗期间不宜同房或使用屏障避孕法，以免感染反复发生。